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Data Transformation¶
We need our data to look something like this for py-irt
{"subject_id": "pedro", "responses": {"q1": 1, "q2": 0, "q3": 1, "q4": 0}}
{"subject_id": "pinguino", "responses": {"q1": 1, "q2": 1, "q3": 0, "q4": 0}}
{"subject_id": "ken", "responses": {"q1": 1, "q2": 1, "q3": 1, "q4": 1}}
{"subject_id": "burt", "responses": {"q1": 0, "q2": 0, "q3": 0, "q4": 0}}
Setup¶
conda create -n ENVNAME python=3.10 pandas
conda activate ENVNAME
conda install -c conda-forge jupyterlab
pip install pandas pyro-ppl py-irt
In [ ]:
!pip install pandas pyro-ppl py-irt
Defaulting to user installation because normal site-packages is not writeable Requirement already satisfied: pandas in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (2.2.1) Requirement already satisfied: pyro-ppl in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (1.9.0) Requirement already satisfied: py-irt in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (0.6.0) Requirement already satisfied: python-dateutil>=2.8.2 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from pandas) (2.9.0.post0) Requirement already satisfied: tzdata>=2022.7 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from pandas) (2024.1) Requirement already satisfied: pytz>=2020.1 in /usr/lib/python3/dist-packages (from pandas) (2022.1) Requirement already satisfied: numpy<2,>=1.22.4 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from pandas) (1.26.4) Requirement already satisfied: pyro-api>=0.1.1 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from pyro-ppl) (0.1.2) Requirement already satisfied: tqdm>=4.36 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from pyro-ppl) (4.66.2) Requirement already satisfied: torch>=2.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from pyro-ppl) (2.0.0) Requirement already satisfied: opt-einsum>=2.3.2 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from pyro-ppl) (3.3.0) Requirement already satisfied: ordered-set<5.0.0,>=4.1.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from py-irt) (4.1.0) Requirement already satisfied: toml<0.11.0,>=0.10.2 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from py-irt) (0.10.2) Requirement already satisfied: rich<14.0.0,>=13.7.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from py-irt) (13.7.1) Requirement already satisfied: scipy<2.0.0,>=1.6.3 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from py-irt) (1.12.0) Requirement already satisfied: scikit-learn<2.0.0,>=1.3.2 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from py-irt) (1.4.1.post1) Requirement already satisfied: typer<0.10.0,>=0.9.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from py-irt) (0.9.0) Requirement already satisfied: pydantic<3.0.0,>=2.5.3 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from py-irt) (2.6.4) Requirement already satisfied: nvidia-cufft-cu11==10.9.0.58 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (10.9.0.58) Requirement already satisfied: jinja2 in /usr/lib/python3/dist-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (3.0.3) Requirement already satisfied: nvidia-cuda-nvrtc-cu11==11.7.99 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (11.7.99) Requirement already satisfied: nvidia-cuda-cupti-cu11==11.7.101 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (11.7.101) Requirement already satisfied: nvidia-nccl-cu11==2.14.3 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (2.14.3) Requirement already satisfied: filelock in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (3.13.1) Requirement already satisfied: networkx in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (3.2.1) Requirement already satisfied: nvidia-curand-cu11==10.2.10.91 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (10.2.10.91) Requirement already satisfied: typing-extensions in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (4.10.0) Requirement already satisfied: nvidia-cusolver-cu11==11.4.0.1 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (11.4.0.1) Requirement already satisfied: nvidia-nvtx-cu11==11.7.91 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (11.7.91) Requirement already satisfied: sympy in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (1.12) Requirement already satisfied: triton==2.0.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (2.0.0) Requirement already satisfied: nvidia-cusparse-cu11==11.7.4.91 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (11.7.4.91) Requirement already satisfied: nvidia-cuda-runtime-cu11==11.7.99 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (11.7.99) Requirement already satisfied: nvidia-cublas-cu11==11.10.3.66 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (11.10.3.66) Requirement already satisfied: nvidia-cudnn-cu11==8.5.0.96 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from torch>=2.0->pyro-ppl) (8.5.0.96) Requirement already satisfied: setuptools in /usr/lib/python3/dist-packages (from nvidia-cublas-cu11==11.10.3.66->torch>=2.0->pyro-ppl) (59.6.0) Requirement already satisfied: wheel in /usr/lib/python3/dist-packages (from nvidia-cublas-cu11==11.10.3.66->torch>=2.0->pyro-ppl) (0.37.1) Requirement already satisfied: lit in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from triton==2.0.0->torch>=2.0->pyro-ppl) (18.1.1) Requirement already satisfied: cmake in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from triton==2.0.0->torch>=2.0->pyro-ppl) (3.28.3) Requirement already satisfied: pydantic-core==2.16.3 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from pydantic<3.0.0,>=2.5.3->py-irt) (2.16.3) Requirement already satisfied: annotated-types>=0.4.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from pydantic<3.0.0,>=2.5.3->py-irt) (0.6.0) Requirement already satisfied: six>=1.5 in /usr/lib/python3/dist-packages (from python-dateutil>=2.8.2->pandas) (1.16.0) Requirement already satisfied: pygments<3.0.0,>=2.13.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from rich<14.0.0,>=13.7.0->py-irt) (2.17.2) Requirement already satisfied: markdown-it-py>=2.2.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from rich<14.0.0,>=13.7.0->py-irt) (3.0.0) Requirement already satisfied: joblib>=1.2.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from scikit-learn<2.0.0,>=1.3.2->py-irt) (1.3.2) Requirement already satisfied: threadpoolctl>=2.0.0 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from scikit-learn<2.0.0,>=1.3.2->py-irt) (3.3.0) Requirement already satisfied: click<9.0.0,>=7.1.1 in /usr/lib/python3/dist-packages (from typer<0.10.0,>=0.9.0->py-irt) (8.0.3) Requirement already satisfied: mdurl~=0.1 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from markdown-it-py>=2.2.0->rich<14.0.0,>=13.7.0->py-irt) (0.1.2) Requirement already satisfied: mpmath>=0.19 in /home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages (from sympy->torch>=2.0->pyro-ppl) (1.3.0)
In [ ]:
import pandas as pd
import json
In [ ]:
import urllib.request
urllib.request.urlretrieve("https://www.johnlalor.net/cola.rp", "cola.rp")
Out[ ]:
('cola.rp', <http.client.HTTPMessage at 0x70a511aa0df0>)
In [ ]:
D = pd.read_csv("cola.rp", sep="\t", names=["modelID","itemID","response"])
D.head()
Out[ ]:
| modelID | itemID | response | |
|---|---|---|---|
| 0 | m-0.34 | 0 | 1 |
| 1 | m-0.34 | 1 | 1 |
| 2 | m-0.34 | 2 | 1 |
| 3 | m-0.34 | 3 | 1 |
| 4 | m-0.34 | 4 | 1 |
In [ ]:
D.head(-10)
Out[ ]:
| modelID | itemID | response | |
|---|---|---|---|
| 0 | m-0.34 | 0 | 1 |
| 1 | m-0.34 | 1 | 1 |
| 2 | m-0.34 | 2 | 1 |
| 3 | m-0.34 | 3 | 1 |
| 4 | m-0.34 | 4 | 1 |
| ... | ... | ... | ... |
| 427535 | m-0.04 | 8536 | 1 |
| 427536 | m-0.04 | 8537 | 1 |
| 427537 | m-0.04 | 8538 | 1 |
| 427538 | m-0.04 | 8539 | 0 |
| 427539 | m-0.04 | 8540 | 1 |
427540 rows × 3 columns
In [ ]:
len(D['modelID'].unique())
Out[ ]:
50
In [ ]:
response_patterns = {}
for idx, row in D.iterrows():
if row["modelID"] not in response_patterns:
response_patterns[row["modelID"]] = {}
response_patterns[row["modelID"]][f"q{row['itemID']}"] = row["response"]
In [ ]:
with open("cola_pyirt.jsonlines", "w") as outfile:
for key, val in response_patterns.items():
outrow = {"subject_id": key, "responses": val}
outfile.write(json.dumps(outrow) + "\n")
In [ ]:
!py-irt train 1pl cola_pyirt.jsonlines output/cola1pl
[22:54:38] config: model_type='1pl' epochs=2000 priors=None ]8;id=891540;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/cli.py\cli.py]8;;\:]8;id=758169;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/cli.py#109\109]8;;\ initializers=[] dims=None lr=0.1 lr_decay=0.9999 dropout=0.5 hidden=100 vocab_size=None log_every=100 seed=None deterministic=False data_path: cola_pyirt.jsonlines ]8;id=946112;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/cli.py\cli.py]8;;\:]8;id=479025;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/cli.py#111\111]8;;\ output directory: output/cola1pl ]8;id=795814;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/cli.py\cli.py]8;;\:]8;id=864928;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/cli.py#112\112]8;;\ [22:54:39] amortized: False ]8;id=829918;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/dataset.py\dataset.py]8;;\:]8;id=832117;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/dataset.py#112\112]8;;\ [22:54:39] Vocab size: None ]8;id=817254;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/training.py\training.py]8;;\:]8;id=498985;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/training.py#92\92]8;;\ [22:54:39] Training Model... ]8;id=572634;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/cli.py\cli.py]8;;\:]8;id=995383;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/cli.py#116\116]8;;\ args: {'device': 'cpu', 'num_items': 8551, ]8;id=723791;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/training.py\training.py]8;;\:]8;id=71406;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/training.py#142\142]8;;\ 'num_subjects': 50} Parsed Model Args: {'device': 'cpu', 'num_items': ]8;id=527149;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/training.py\training.py]8;;\:]8;id=210101;file:///home/lalor/.local/lib/python3.10/site-packages/py_irt/training.py#155\155]8;;\ 8551, 'num_subjects': 50, 'priors': 'vague', 'dropout': 0.5, 'hidden': 100, 'vocab_size': None} torch.Size([427550]) torch.Size([427550]) ┏━━━━━━━┳━━━━━━┳━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━╇━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ Training Pyro IRT Model for 2000 epochs ┏━━━━━━━┳━━━━━━┳━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━╇━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ 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│ 164444.8879 │ 157288.6199 │ 0.0942 │ │ 701 │ 143515.2246 │ 139251.5357 │ 0.0932 │ │ 801 │ 125168.3612 │ 125168.3612 │ 0.0923 │ │ 901 │ 117803.3194 │ 117803.3194 │ 0.0914 │ │ 1001 │ 114995.0111 │ 111405.2877 │ 0.0905 │ │ 1101 │ 109696.6836 │ 105482.8625 │ 0.0896 │ │ 1201 │ 105368.5114 │ 101405.1844 │ 0.0887 │ │ 1301 │ 99759.7031 │ 98784.9466 │ 0.0878 │ │ 1401 │ 96650.3548 │ 95032.3771 │ 0.0869 │ │ 1501 │ 93701.3843 │ 93445.7631 │ 0.0861 │ │ 1601 │ 92623.4340 │ 91099.1904 │ 0.0852 │ │ 1701 │ 89875.6881 │ 88591.7537 │ 0.0844 │ │ 1801 │ 86994.5612 │ 86828.9584 │ 0.0835 │ │ 1901 │ 86688.6070 │ 85059.0908 │ 0.0827 │ ┏━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━━━━━━━━━┳━━━━━━━━┓ ┃ Epoch ┃ Loss ┃ Best Loss ┃ New LR ┃ ┡━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━━━━━━━━━╇━━━━━━━━┩ │ 1 │ 169078784.0000 │ 169078784.0000 │ 0.1000 │ │ 101 │ 7520734.5738 │ 7520734.5738 │ 0.0990 │ │ 201 │ 2003611.3890 │ 1936137.6781 │ 0.0980 │ │ 301 │ 679321.1967 │ 679321.1967 │ 0.0970 │ │ 401 │ 340807.6144 │ 314330.5051 │ 0.0961 │ │ 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!cat output/cola1pl/best_parameters.json
or
!type output\cola1pl\best_parameters.json
depending on your operating system.
In [ ]:
with open ("output/cola1pl/best_parameters.json","r") as file:
data = json.load(file)
data.keys()
Out[ ]:
dict_keys(['ability', 'diff', 'irt_model', 'item_ids', 'subject_ids'])
In [ ]:
len(data["diff"])
Out[ ]:
8551
In [ ]:
items = pd.DataFrame(
index=data["item_ids"],
data= data["diff"],
columns=["diff"]
)
items.head()
Out[ ]:
| diff | |
|---|---|
| 0 | -22.281200 |
| 1 | -21.512703 |
| 2 | -19.260849 |
| 3 | -19.801846 |
| 4 | -18.036003 |
In [ ]:
subjects = pd.DataFrame(
index=data["subject_ids"],
data= data["ability"],
columns=["ability"]
)
subjects.head()
Out[ ]:
| ability | |
|---|---|
| 0 | 9.439343 |
| 1 | 10.120603 |
| 2 | 8.916849 |
| 3 | 9.229851 |
| 4 | 8.850241 |